Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms