Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp30Q3UN04 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp30Q3UN04 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp30Q3UN04 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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