Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrch2Q3UMG5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms