Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm648Q3UJ22 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm648Q3UJ22 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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