Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms