Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LbrQ3U9G9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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