Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf166Q3U9F6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf166Q3U9F6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms