Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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