Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ulk3Q3U3Q1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ulk3Q3U3Q1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ulk3Q3U3Q1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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