Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms