Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rnf149Q3U2C5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Rnf149Q3U2C5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf149Q3U2C5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf149Q3U2C5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf149Q3U2C5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rnf149Q3U2C5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf149Q3U2C5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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