Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms