Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hace1Q3U0D9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms