Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc136Q3TVA9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms