Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Shcbp1lQ3TTP0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms