Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fndc4Q3TR08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fndc4Q3TR08 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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