Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cwc27Q3TKY6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms