Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca4Q3TKT4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca4Q3TKT4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms