Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sppl2bQ3TD49 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms