Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss1Q33DR2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss1Q33DR2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms