Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrna5Q2MKA5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms