Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd11Q1RNF8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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