Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Myo3bQ1EG27 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Myo3bQ1EG27 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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