Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cers3Q1A3B0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cers3Q1A3B0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms