Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd2Q149F1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd2Q149F1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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