Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Traf3ip1Q149C2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3ip1Q149C2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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