Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Perm1Q149B8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Perm1Q149B8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms