Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms