Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col19a1Q0VF58 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col19a1Q0VF58 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms