Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne7Q0VE82 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms