Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itgb8Q0VBD0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms