Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NeblQ0II04 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NeblQ0II04 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms