Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col17a1Q07563 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms