Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah1bQ06985 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms