Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprgQ05909 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprgQ05909 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms