Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcn1Q05186 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms