Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox12Q04890 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms