Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RelaQ04207 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RelaQ04207 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms