Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnb1Q03717 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms