Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scg2Q03517 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scg2Q03517 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms