Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Thbs2Q03350 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms