Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfiaQ02780 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms