Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax5Q02650 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax5Q02650 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax5Q02650 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax5Q02650 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pax5Q02650 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms