Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GscQ02591 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GscQ02591 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GscQ02591 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GscQ02591 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GscQ02591 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GscQ02591 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GscQ02591 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GscQ02591 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GscQ02591 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms