Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai1Q02085 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms