Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms