Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mc1rQ01727 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms