Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HmgcrQ01237 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HmgcrQ01237 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms