Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja5Q01231 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms