Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin2cQ01098 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms